تختلف الأعراض المصاحبة لفتحات القلب وفقاً لنوع الفتحة على النّحو الآتي: أعراض عيب الحاجز الأذيني قد لا يعاني الكثير من الأطفال المصابين بعيب الحاجز الأذيني من أيّة أعراض، إلّا أنّ ذلك يعتمد بشكل رئيس على مكان وحجم الفتحة، ففتحات القلب صغيرة الحجم قد لا تسبب أيّة أعراض، وغالباً ما تلتئم وحدها في مرحلة الطفولة المبكّرة، أو قد يعاني المريض بسببها من ضيق في التنفس أو تكرار الإصابة بالتهابات المجاري التنفسيّة، أو الشعور بخفقان القلب، وقد لا تظهر هذه الأعراض إلّا بعد التقدم بالعمر. أمّا في حال المعاناة من فتحات كبيرة الحجم فقد تظهر الأعراض السابقة بشكل أكثر شدّة وفي أعمار أصغر، بالإضافة إلى المعاناة من فقدان الشهيّة واضطراب النمو والشعور بالتعب والإعياء باستمرار، وقد تؤدي الفتحات كبيرة الحجم، خصوصاً في حال بقائها دون علاج إلى الإصابة بقصور عضلة القلب، عندها قد يعاني المريض بالإضافة إلى الأعراض السابقة من تجمع السوائل في الرئتين، وكذلك تورّم الكاحلين أو القدمين أو البطن. ومن أكثر علامات الإصابة بعيب الحاجز الأذيني شيوعاً ظهور ما يسمّى بالنفخة القلبيّة، وهي عبارة عن صوت إضافيّ غير طبيعي يُسمع في نبض القلب.